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boxshade

Pretty-printing of multiple sequence alignments

/Main/Debian/armel/science/

Boxshade is a program for creating good looking printouts from multiple-aligned protein or DNA sequences. The program does not perform the alignment by itself and requires as input a file that was created by a multiple alignment program or manually edited with respective tools.

Boxshade reads multiple-aligned sequences from either PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data and ESEE-save files (limited to a maximum of 150 sequences with up to 10000 elements each). Various kinds of shading can be applied to identical/similar residues. Output is written to screen or to a file in the following formats: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Info:

Homepage:	-
Package version:	3.3.1-4
Architecture:	armel
Distribution:	Debian
Filename:	boxshade_3.3.1-4_armel.deb

Browse inside boxshade_3.3.1-4_armel.deb:

pkg://boxshade_3.3.1-4_armel.deb:53924/  info  downloads

[DIR]usr/  65535+ twin directories
160 B  2007-08-25postrm  view  56819+ mirrors
185 B  2007-08-25postinst  view  38275+ mirrors
451 B  2007-08-25md5sums  view  536+ mirrors
[DIR]etc/  65535+ twin directories
1.09 KB  2007-08-25control  view  391+ mirrors
314 B  2007-08-25conffiles  view  65 mirrors

Download boxshade_3.3.1-4_armel.deb:

2007-08-25  ftp://ftp.linux.it/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.cesca.es/mirror/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.uni-frankfurt.de/pub/Mirrors3/debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://debian.lcs.mit.edu/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.kfki.hu/pub/linux/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.skynet.be/mirror1/debian.org/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.prz.rzeszow.pl/pub/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.wustl.edu/pub/linux/distributions/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.nz.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2008-08-23  ftp://ftp.uni-stuttgart.de/pub/mirror/ftp.de.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.uni-hannover.de/pub/mirror/linux/debian-mirror/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.port80.se/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2008-08-23  ftp://ftp.cs.iastate.edu/pub/linux/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.kulnet.kuleuven.ac.be/mirror/ftp.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.uni-koeln.de/mirrors/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.wh2.tu-dresden.de/pub/mirrors/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.uni-kassel.de/Mirrors1/ftp.de.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://24.215.0.24/Debian/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.rfc822.org/pub/mirror/ftp.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.fr.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.lf.net/pub/Mirrors/ftp.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://sapi.vlsm.org/.1/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.cl.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.mars.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://64.15.134.18/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2008-08-23  ftp://ftp.ps.pl/dsk0/ftp.debian.org/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.free.fr/.mirrors1/ftp.debian.org/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2008-08-23  ftp://ftp13.freebsd.org/pub/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.ankara.edu.tr/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.fi.debian.org/pub/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.nl.kernel.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.zcu.cz/pub/linux/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.auckland.ac.nz/linux/dists/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.tu-ilmenau.de/Mirrors/ftp.de.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://161.53.160.16/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.carnet.hr/misc/.ftp.hr.debian.org/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://193.219.61.67/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.med.univ-tours.fr/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2008-08-23  ftp://ftp.psn.ru/pub/Linux/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.linux.pt/pub/mirrors/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.sac.sk/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://64.50.238.52/.1/debian/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.crihan.fr/mirrors/ftp.debian.org/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://64.50.236.52/.1/debian/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-26  ftp://ftp.song.fi/pub/mirrors/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.tiscali.nl/pub/mirror/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.demon.nl/disk3/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2008-08-23  ftp://ftp.externet.hu/.lib/disk1/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://147.52.159.12/mirrors/linux/debian/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb
2007-08-25  ftp://ftp.wsisiz.edu.pl/pub/Linux/Debian/ftp.debian.org/pool/main/b/boxshade/boxshade_3.3.1-4_armel.deb